Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTC41PQ6P2S7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TTC41PQ6P2S7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms