Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE9

LCN8, Epididymal-specific lipocalin-8, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN8Q6JVE9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LCN8Q6JVE9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LCN8Q6JVE9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LCN8Q6JVE9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LCN8Q6JVE9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LCN8Q6JVE9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LCN8Q6JVE9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LCN8Q6JVE9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LCN8Q6JVE9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LCN8Q6JVE9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LCN8Q6JVE9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LCN8Q6JVE9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LCN8Q6JVE9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LCN8Q6JVE9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LCN8Q6JVE9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
LCN8Q6JVE9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
LCN8Q6JVE9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LCN8Q6JVE9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms