Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG9BQ674R7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATG9BQ674R7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATG9BQ674R7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATG9BQ674R7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
ATG9BQ674R7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATG9BQ674R7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
ATG9BQ674R7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG9BQ674R7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG9BQ674R7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG9BQ674R7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG9BQ674R7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG9BQ674R7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG9BQ674R7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG9BQ674R7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms