Protein–RNA interactions for Protein: Q5TYX0

PRAMEF5, PRAME family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF5Q5TYX0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRAMEF5Q5TYX0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRAMEF5Q5TYX0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms