Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD5Q5TGI4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD5Q5TGI4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD5Q5TGI4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD5Q5TGI4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD5Q5TGI4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD5Q5TGI4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD5Q5TGI4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD5Q5TGI4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD5Q5TGI4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD5Q5TGI4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD5Q5TGI4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD5Q5TGI4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD5Q5TGI4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD5Q5TGI4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD5Q5TGI4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD5Q5TGI4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SAMD5Q5TGI4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SAMD5Q5TGI4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms