Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC27A3Q5K4L6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
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