Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GREB1Q4ZG55 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GREB1Q4ZG55 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms