Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC96Q2M329 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC96Q2M329 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms