Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM187BQ17R55 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM187BQ17R55 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms