Protein–RNA interactions for Protein: Q16873

LTC4S, Leukotriene C4 synthase, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTC4SQ16873 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTC4SQ16873 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LTC4SQ16873 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTC4SQ16873 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTC4SQ16873 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTC4SQ16873 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTC4SQ16873 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTC4SQ16873 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LTC4SQ16873 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTC4SQ16873 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTC4SQ16873 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTC4SQ16873 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTC4SQ16873 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTC4SQ16873 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTC4SQ16873 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LTC4SQ16873 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTC4SQ16873 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTC4SQ16873 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTC4SQ16873 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTC4SQ16873 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTC4SQ16873 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTC4SQ16873 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTC4SQ16873 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTC4SQ16873 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTC4SQ16873 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTC4SQ16873 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LTC4SQ16873 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTC4SQ16873 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LTC4SQ16873 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTC4SQ16873 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms