Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLPPQ16740 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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