Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
VPS72Q15906 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
VPS72Q15906 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VPS72Q15906 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
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