Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SF1Q15637 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SF1Q15637 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SF1Q15637 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SF1Q15637 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SF1Q15637 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SF1Q15637 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SF1Q15637 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SF1Q15637 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SF1Q15637 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SF1Q15637 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SF1Q15637 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SF1Q15637 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SF1Q15637 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SF1Q15637 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SF1Q15637 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SF1Q15637 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SF1Q15637 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SF1Q15637 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SF1Q15637 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SF1Q15637 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SF1Q15637 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SF1Q15637 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SF1Q15637 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SF1Q15637 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SF1Q15637 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SF1Q15637 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SF1Q15637 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SF1Q15637 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SF1Q15637 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SF1Q15637 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SF1Q15637 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SF1Q15637 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SF1Q15637 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SF1Q15637 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SF1Q15637 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SF1Q15637 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SF1Q15637 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SF1Q15637 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SF1Q15637 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SF1Q15637 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SF1Q15637 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SF1Q15637 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SF1Q15637 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SF1Q15637 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SF1Q15637 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SF1Q15637 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SF1Q15637 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SF1Q15637 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SF1Q15637 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SF1Q15637 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SF1Q15637 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SF1Q15637 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SF1Q15637 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SF1Q15637 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SF1Q15637 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SF1Q15637 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SF1Q15637 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SF1Q15637 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SF1Q15637 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SF1Q15637 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SF1Q15637 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SF1Q15637 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SF1Q15637 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SF1Q15637 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SF1Q15637 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SF1Q15637 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SF1Q15637 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SF1Q15637 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SF1Q15637 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SF1Q15637 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SF1Q15637 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SF1Q15637 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SF1Q15637 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SF1Q15637 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SF1Q15637 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SF1Q15637 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SF1Q15637 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SF1Q15637 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SF1Q15637 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SF1Q15637 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SF1Q15637 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SF1Q15637 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SF1Q15637 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SF1Q15637 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SF1Q15637 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SF1Q15637 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SF1Q15637 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SF1Q15637 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SF1Q15637 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SF1Q15637 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SF1Q15637 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SF1Q15637 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SF1Q15637 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SF1Q15637 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SF1Q15637 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SF1Q15637 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SF1Q15637 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SF1Q15637 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SF1Q15637 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
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