Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX17Q15036 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SNX17Q15036 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX17Q15036 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX17Q15036 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX17Q15036 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX17Q15036 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX17Q15036 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX17Q15036 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX17Q15036 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX17Q15036 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX17Q15036 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX17Q15036 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX17Q15036 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX17Q15036 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX17Q15036 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX17Q15036 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX17Q15036 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX17Q15036 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX17Q15036 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX17Q15036 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX17Q15036 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX17Q15036 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX17Q15036 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX17Q15036 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX17Q15036 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX17Q15036 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
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