Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SCN5AQ14524 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCN5AQ14524 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
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