Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM25Q14258 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM25Q14258 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM25Q14258 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM25Q14258 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM25Q14258 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM25Q14258 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM25Q14258 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM25Q14258 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM25Q14258 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM25Q14258 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM25Q14258 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM25Q14258 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM25Q14258 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM25Q14258 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM25Q14258 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM25Q14258 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM25Q14258 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM25Q14258 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM25Q14258 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM25Q14258 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM25Q14258 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM25Q14258 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM25Q14258 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM25Q14258 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM25Q14258 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM25Q14258 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM25Q14258 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM25Q14258 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM25Q14258 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM25Q14258 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM25Q14258 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM25Q14258 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM25Q14258 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM25Q14258 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM25Q14258 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM25Q14258 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM25Q14258 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM25Q14258 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms