Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCARF1Q14162 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
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