Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCINQ13939 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCINQ13939 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCINQ13939 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCINQ13939 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCINQ13939 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCINQ13939 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCINQ13939 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCINQ13939 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCINQ13939 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCINQ13939 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCINQ13939 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCINQ13939 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCINQ13939 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCINQ13939 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCINQ13939 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCINQ13939 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCINQ13939 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCINQ13939 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCINQ13939 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCINQ13939 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCINQ13939 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCINQ13939 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCINQ13939 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCINQ13939 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCINQ13939 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCINQ13939 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCINQ13939 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCINQ13939 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCINQ13939 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCINQ13939 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCINQ13939 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCINQ13939 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCINQ13939 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCINQ13939 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCINQ13939 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCINQ13939 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCINQ13939 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCINQ13939 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCINQ13939 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCINQ13939 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCINQ13939 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCINQ13939 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCINQ13939 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCINQ13939 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCINQ13939 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCINQ13939 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCINQ13939 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCINQ13939 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCINQ13939 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCINQ13939 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCINQ13939 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCINQ13939 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCINQ13939 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCINQ13939 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCINQ13939 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCINQ13939 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCINQ13939 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCINQ13939 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCINQ13939 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCINQ13939 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCINQ13939 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCINQ13939 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCINQ13939 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCINQ13939 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCINQ13939 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCINQ13939 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCINQ13939 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCINQ13939 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCINQ13939 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCINQ13939 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCINQ13939 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCINQ13939 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCINQ13939 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCINQ13939 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCINQ13939 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCINQ13939 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCINQ13939 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCINQ13939 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCINQ13939 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCINQ13939 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCINQ13939 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCINQ13939 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCINQ13939 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCINQ13939 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCINQ13939 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCINQ13939 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCINQ13939 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCINQ13939 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCINQ13939 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCINQ13939 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCINQ13939 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCINQ13939 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCINQ13939 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCINQ13939 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCINQ13939 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCINQ13939 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCINQ13939 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCINQ13939 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCINQ13939 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
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