Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPTAN1Q13813 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
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