Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KRR1Q13601 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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