Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATRQ13535 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATRQ13535 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATRQ13535 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATRQ13535 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATRQ13535 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ATRQ13535 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATRQ13535 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATRQ13535 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATRQ13535 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATRQ13535 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATRQ13535 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATRQ13535 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATRQ13535 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATRQ13535 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATRQ13535 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATRQ13535 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATRQ13535 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATRQ13535 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ATRQ13535 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ATRQ13535 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATRQ13535 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATRQ13535 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATRQ13535 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATRQ13535 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATRQ13535 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATRQ13535 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATRQ13535 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATRQ13535 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATRQ13535 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATRQ13535 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATRQ13535 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATRQ13535 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ATRQ13535 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ATRQ13535 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATRQ13535 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATRQ13535 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATRQ13535 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATRQ13535 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ATRQ13535 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATRQ13535 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATRQ13535 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATRQ13535 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATRQ13535 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATRQ13535 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATRQ13535 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATRQ13535 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATRQ13535 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATRQ13535 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATRQ13535 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ATRQ13535 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATRQ13535 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATRQ13535 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATRQ13535 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATRQ13535 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATRQ13535 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATRQ13535 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATRQ13535 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATRQ13535 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATRQ13535 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATRQ13535 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATRQ13535 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATRQ13535 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATRQ13535 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATRQ13535 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATRQ13535 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATRQ13535 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ATRQ13535 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATRQ13535 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATRQ13535 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATRQ13535 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATRQ13535 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATRQ13535 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATRQ13535 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATRQ13535 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATRQ13535 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATRQ13535 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATRQ13535 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATRQ13535 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATRQ13535 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATRQ13535 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATRQ13535 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATRQ13535 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ATRQ13535 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATRQ13535 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATRQ13535 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATRQ13535 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATRQ13535 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATRQ13535 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATRQ13535 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ATRQ13535 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ATRQ13535 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATRQ13535 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ATRQ13535 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATRQ13535 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATRQ13535 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ATRQ13535 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATRQ13535 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ATRQ13535 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ATRQ13535 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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