Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

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Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PICALMQ13492 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
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