Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TCIRG1Q13488 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
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