Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MKRN4PQ13434 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
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