Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGB3BPQ13352 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
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