Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 QPRT-201ENST00000219771 913 ntTSL 217.89■□□□□ 0.452e-7■■■■□ 22
ILF3Q12906 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.262e-7■■■■□ 22
ILF3Q12906 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.192e-7■■■■□ 22
ILF3Q12906 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.036e-14■■■■□ 22
ILF3Q12906 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.186e-14■■■■□ 22
ILF3Q12906 FOXRED2-202ENST00000366463 2489 ntTSL 211.61□□□□□ -0.556e-14■■■■□ 22
ILF3Q12906 KDM5B-205ENST00000467487 529 ntTSL 317.75■□□□□ 0.431e-8■■■■□ 22
ILF3Q12906 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.141e-8■■■■□ 22
ILF3Q12906 KDM5B-201ENST00000235790 4418 ntTSL 213.52□□□□□ -0.251e-8■■■■□ 22
ILF3Q12906 KDM5B-203ENST00000367265 10345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.51e-8■■■■□ 22
ILF3Q12906 KDM5B-210ENST00000602511 542 ntTSL 57.98□□□□□ -1.131e-8■■■■□ 22
ILF3Q12906 KDM5B-206ENST00000470573 535 ntTSL 46.99□□□□□ -1.291e-8■■■■□ 22
ILF3Q12906 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.673e-8■■■■□ 22
ILF3Q12906 KLHL22-208ENST00000470335 824 ntTSL 220.09■□□□□ 0.813e-7■■■■□ 22
ILF3Q12906 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.173e-7■■■■□ 22
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ILF3Q12906 KLHL22-207ENST00000458248 742 ntTSL 315.01□□□□□ -0.013e-7■■■■□ 22
ILF3Q12906 KLHL22-205ENST00000444967 1045 ntTSL 314.8□□□□□ -0.043e-7■■■■□ 22
ILF3Q12906 KLHL22-212ENST00000494929 550 ntTSL 414.44□□□□□ -0.13e-7■■■■□ 22
ILF3Q12906 KLHL22-204ENST00000443285 792 ntTSL 414.29□□□□□ -0.123e-7■■■■□ 22
ILF3Q12906 KLHL22-209ENST00000479601 1389 ntTSL 513.72□□□□□ -0.213e-7■■■■□ 22
ILF3Q12906 KLHL22-206ENST00000451553 724 ntTSL 311.72□□□□□ -0.533e-7■■■■□ 22
ILF3Q12906 AATF-202ENST00000613840 648 ntTSL 219.26■□□□□ 0.676e-6■■■■□ 22
ILF3Q12906 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.336e-6■■■■□ 22
ILF3Q12906 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.065e-7■■■■□ 22
ILF3Q12906 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.465e-7■■■■□ 22
ILF3Q12906 ASCC1-217ENST00000532011 569 ntTSL 410.74□□□□□ -0.695e-7■■■■□ 22
ILF3Q12906 ASCC1-213ENST00000527593 580 ntTSL 49.01□□□□□ -0.975e-7■■■■□ 22
ILF3Q12906 ASCC1-202ENST00000317168 2002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.055e-7■■■■□ 22
ILF3Q12906 ASCC1-215ENST00000530461 548 ntTSL 48.49□□□□□ -1.055e-7■■■■□ 22
ILF3Q12906 ASCC1-207ENST00000486689 1798 ntTSL 57.75□□□□□ -1.175e-7■■■■□ 22
ILF3Q12906 ASCC1-201ENST00000317126 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.275e-7■■■■□ 22
ILF3Q12906 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.365e-7■■■■□ 22
ILF3Q12906 ASCC1-206ENST00000461369 640 ntTSL 36.16□□□□□ -1.425e-7■■■■□ 22
ILF3Q12906 ASCC1-209ENST00000524829 581 ntTSL 45.88□□□□□ -1.475e-7■■■■□ 22
ILF3Q12906 ASCC1-216ENST00000531048 450 ntTSL 53.24□□□□□ -1.895e-7■■■■□ 22
ILF3Q12906 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.295e-7■■■■□ 22
ILF3Q12906 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.225e-7■■■■□ 22
ILF3Q12906 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.045e-7■■■■□ 22
ILF3Q12906 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.035e-7■■■■□ 22
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ILF3Q12906 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.35e-7■■■■□ 22
ILF3Q12906 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.335e-7■■■■□ 22
ILF3Q12906 MFSD11-201ENST00000336509 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.485e-7■■■■□ 22
ILF3Q12906 MFSD11-206ENST00000585958 575 ntTSL 43.75□□□□□ -1.815e-7■■■■□ 22
ILF3Q12906 MFSD11-214ENST00000588768 843 ntTSL 33.73□□□□□ -1.815e-7■■■■□ 22
ILF3Q12906 MFSD11-203ENST00000585584 536 ntTSL 32.43□□□□□ -2.025e-7■■■■□ 22
ILF3Q12906 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.126e-7■■■■□ 22
ILF3Q12906 SERGEF-207ENST00000527494 1314 ntTSL 521.46■■□□□ 1.036e-7■■■■□ 22
ILF3Q12906 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.66e-7■■■■□ 22
ILF3Q12906 SERGEF-205ENST00000525422 1525 ntTSL 1 (best)16.86■□□□□ 0.296e-7■■■■□ 22
ILF3Q12906 SERGEF-209ENST00000528369 559 ntTSL 314.39□□□□□ -0.116e-7■■■■□ 22
ILF3Q12906 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.196e-7■■■■□ 22
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ILF3Q12906 SERGEF-210ENST00000529151 898 ntTSL 312.98□□□□□ -0.336e-7■■■■□ 22
ILF3Q12906 SERGEF-221ENST00000532546 833 ntTSL 312.3□□□□□ -0.446e-7■■■■□ 22
ILF3Q12906 SERGEF-206ENST00000525920 497 ntTSL 311.58□□□□□ -0.566e-7■■■■□ 22
ILF3Q12906 SERGEF-222ENST00000533241 539 ntTSL 46.61□□□□□ -1.356e-7■■■■□ 22
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ILF3Q12906 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.22e-6■■■■□ 22
ILF3Q12906 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.082e-6■■■■□ 22
ILF3Q12906 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.612e-6■■■■□ 22
ILF3Q12906 ZNRF1-203ENST00000564320 607 ntTSL 38.61□□□□□ -1.032e-6■■■■□ 22
ILF3Q12906 ZNRF1-209ENST00000568511 485 ntTSL 48.5□□□□□ -1.052e-6■■■■□ 22
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ILF3Q12906 GLG1-209ENST00000565260 461 ntTSL 526.98■■□□□ 1.912e-6■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.722e-6■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 GLG1-213ENST00000567951 2918 ntTSL 1 (best)17.39■□□□□ 0.372e-6■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.162e-6■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.072e-6■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.152e-6■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 GLG1-206ENST00000562090 4037 ntTSL 213.55□□□□□ -0.242e-6■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 CBX3-204ENST00000456948 1068 ntTSL 523.07■■□□□ 1.281e-7■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.184e-6■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 GLRX3-203ENST00000481034 1921 ntTSL 1 (best)20.34■□□□□ 0.854e-6■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 MIPOL1-212ENST00000556615 732 ntTSL 317.34■□□□□ 0.372e-6■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.365e-12■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.051e-7■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.131e-7■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.141e-7■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.34e-6■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 ZNF33A-205ENST00000469037 1530 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.342e-6■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 MIPOL1-209ENST00000554930 1377 ntTSL 512.84□□□□□ -0.352e-6■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 MIPOL1-213ENST00000556753 775 ntTSL 512.52□□□□□ -0.412e-6■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 ZNF33A-207ENST00000478556 539 ntTSL 311.83□□□□□ -0.522e-6■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 CBX3-205ENST00000462165 949 ntTSL 310.86□□□□□ -0.671e-7■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 MIPOL1-202ENST00000396294 6258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.92e-6■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 MIPOL1-211ENST00000556451 2282 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.052e-6■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 ZNF33A-208ENST00000628825 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.112e-6■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 STK4-202ENST00000372806 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.215e-12■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 ZNF33A-204ENST00000458705 6084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.222e-6■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 PSMD1-207ENST00000447633 696 ntTSL 26.96□□□□□ -1.35e-12■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.335e-12■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.342e-6■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 MIPOL1-210ENST00000555870 7434 ntTSL 1 (best)6.3□□□□□ -1.42e-6■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 PANK2-204ENST00000471830 622 ntTSL 36.19□□□□□ -1.422e-7■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.482e-6■■■■□ 21.9
ILF3Q12906 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.522e-6■■■■□ 21.9
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