Protein–RNA interactions for Protein: Q12276

HER1, HMG2-induced ER-remodeling protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HER1Q12276 NRP1YDL167C 2160 nt3.8□□□□□ -1.8
HER1Q12276 MTC4YBR255W 2085 nt3.8□□□□□ -1.8
HER1Q12276 APN2YBL019W 1563 nt3.8□□□□□ -1.8
HER1Q12276 CHD1YER164W 4407 nt3.79□□□□□ -1.8
HER1Q12276 YDR131CYDR131C 1671 nt3.79□□□□□ -1.8
HER1Q12276 MTM1YGR257C 1101 nt3.79□□□□□ -1.8
HER1Q12276 YGR293CYGR293C 462 nt3.79□□□□□ -1.8
HER1Q12276 YJR112W-AYJR112W-A 330 nt3.79□□□□□ -1.8
HER1Q12276 RPS30AYLR287C-A 192 nt3.79□□□□□ -1.8
HER1Q12276 MIX23YBL107C 591 nt3.79□□□□□ -1.8
HER1Q12276 RIB4YOL143C 510 nt3.79□□□□□ -1.8
HER1Q12276 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt3.79□□□□□ -1.8
HER1Q12276 YBR300CYBR300C 498 nt3.79□□□□□ -1.8
HER1Q12276 SMI1YGR229C 1518 nt3.79□□□□□ -1.8
HER1Q12276 RAD18YCR066W 1464 nt3.79□□□□□ -1.8
HER1Q12276 SPT6YGR116W 4356 nt3.79□□□□□ -1.8
HER1Q12276 GAC1YOR178C 2382 nt3.78□□□□□ -1.8
HER1Q12276 CET1YPL228W 1650 nt3.78□□□□□ -1.8
HER1Q12276 TGL2YDR058C 981 nt3.78□□□□□ -1.8
HER1Q12276 YDR248CYDR248C 582 nt3.78□□□□□ -1.8
HER1Q12276 PHM6YDR281C 315 nt3.78□□□□□ -1.8
HER1Q12276 YER034WYER034W 558 nt3.78□□□□□ -1.8
HER1Q12276 POG1YIL122W 1056 nt3.78□□□□□ -1.8
HER1Q12276 YVH1YIR026C 1095 nt3.78□□□□□ -1.8
HER1Q12276 CAP1YKL007W 807 nt3.78□□□□□ -1.8
HER1Q12276 RPN13YLR421C 471 nt3.78□□□□□ -1.8
HER1Q12276 ASC1YMR116C 960 nt3.78□□□□□ -1.8
HER1Q12276 PEX15YOL044W 1152 nt3.78□□□□□ -1.8
HER1Q12276 USV1YPL230W 1176 nt3.78□□□□□ -1.8
HER1Q12276 YPR078CYPR078C 1119 nt3.78□□□□□ -1.8
HER1Q12276 SCD6YPR129W 1050 nt3.78□□□□□ -1.8
HER1Q12276 YPR172WYPR172W 603 nt3.78□□□□□ -1.8
HER1Q12276 YCL002CYCL002C 792 nt3.78□□□□□ -1.8
HER1Q12276 SPR3YGR059W 1539 nt3.78□□□□□ -1.8
HER1Q12276 YVC1YOR087W 2028 nt3.78□□□□□ -1.8
HER1Q12276 ULP1YPL020C 1866 nt3.77□□□□□ -1.81
HER1Q12276 BUD25YER014C-A 462 nt3.77□□□□□ -1.81
HER1Q12276 SNO3YFL060C 669 nt3.77□□□□□ -1.81
HER1Q12276 YGR109W-AYGR109W-A 873 nt3.77□□□□□ -1.81
HER1Q12276 RPS4BYHR203C 786 nt3.77□□□□□ -1.81
HER1Q12276 YIL082WYIL082W 873 nt3.77□□□□□ -1.81
HER1Q12276 EFB1YAL003W 621 nt3.77□□□□□ -1.81
HER1Q12276 PET130YJL023C 1044 nt3.77□□□□□ -1.81
HER1Q12276 BET4YJL031C 984 nt3.77□□□□□ -1.81
HER1Q12276 YJR141WYJR141W 1044 nt3.77□□□□□ -1.81
HER1Q12276 RPS4AYJR145C 786 nt3.77□□□□□ -1.81
HER1Q12276 IES3YLR052W 753 nt3.77□□□□□ -1.81
HER1Q12276 SNO2YNL334C 669 nt3.77□□□□□ -1.81
HER1Q12276 IOC2YLR095C 2439 nt3.77□□□□□ -1.81
HER1Q12276 FUN12YAL035W 3009 nt3.77□□□□□ -1.81
HER1Q12276 YGR117CYGR117C 1431 nt3.77□□□□□ -1.81
HER1Q12276 SST2YLR452C 2097 nt3.77□□□□□ -1.81
HER1Q12276 DSS1YMR287C 2910 nt3.77□□□□□ -1.81
HER1Q12276 NSA1YGL111W 1392 nt3.76□□□□□ -1.81
HER1Q12276 MET17YLR303W 1335 nt3.76□□□□□ -1.81
HER1Q12276 DSN1YIR010W 1731 nt3.76□□□□□ -1.81
HER1Q12276 ACA1YER045C 1470 nt3.76□□□□□ -1.81
HER1Q12276 TMA17YDL110C 453 nt3.76□□□□□ -1.81
HER1Q12276 YGR126WYGR126W 693 nt3.76□□□□□ -1.81
HER1Q12276 CDC12YHR107C 1224 nt3.76□□□□□ -1.81
HER1Q12276 YLR154W-BYLR154W-B 165 nt3.76□□□□□ -1.81
HER1Q12276 HSH49YOR319W 642 nt3.76□□□□□ -1.81
HER1Q12276 TRM11YOL124C 1302 nt3.75□□□□□ -1.81
HER1Q12276 BUD27YFL023W 2391 nt3.75□□□□□ -1.81
HER1Q12276 PRP11YDL043C 801 nt3.75□□□□□ -1.81
HER1Q12276 DTD1YDL219W 453 nt3.75□□□□□ -1.81
HER1Q12276 GUK1YDR454C 564 nt3.75□□□□□ -1.81
HER1Q12276 YDR526CYDR526C 471 nt3.75□□□□□ -1.81
HER1Q12276 YDR535CYDR535C 501 nt3.75□□□□□ -1.81
HER1Q12276 YER158W-AYER158W-A 216 nt3.75□□□□□ -1.81
HER1Q12276 YGL082WYGL082W 1146 nt3.75□□□□□ -1.81
HER1Q12276 TAD1YGL243W 1203 nt3.75□□□□□ -1.81
HER1Q12276 YGR160WYGR160W 612 nt3.75□□□□□ -1.81
HER1Q12276 REC104YHR157W 549 nt3.75□□□□□ -1.81
HER1Q12276 YAL004WYAL004W 648 nt3.75□□□□□ -1.81
HER1Q12276 SFT1YKL006C-A 294 nt3.75□□□□□ -1.81
HER1Q12276 YKL131WYKL131W 522 nt3.75□□□□□ -1.81
HER1Q12276 COS1YNL336W 1146 nt3.75□□□□□ -1.81
HER1Q12276 PET123YOR158W 957 nt3.75□□□□□ -1.81
HER1Q12276 CEX1YOR112W 2286 nt3.75□□□□□ -1.81
HER1Q12276 PLM2YDR501W 1566 nt3.75□□□□□ -1.81
HER1Q12276 DAP2YHR028C 2457 nt3.75□□□□□ -1.81
HER1Q12276 IMH1YLR309C 2736 nt3.74□□□□□ -1.81
HER1Q12276 ZDS1YMR273C 2748 nt3.74□□□□□ -1.81
HER1Q12276 MCM7YBR202W 2538 nt3.74□□□□□ -1.81
HER1Q12276 ERP3YDL018C 678 nt3.74□□□□□ -1.81
HER1Q12276 NKP1YDR383C 717 nt3.74□□□□□ -1.81
HER1Q12276 API2YDR525W 330 nt3.74□□□□□ -1.81
HER1Q12276 HCA4YJL033W 2313 nt3.74□□□□□ -1.81
HER1Q12276 GPX1YKL026C 504 nt3.74□□□□□ -1.81
HER1Q12276 MOH1YBL049W 417 nt3.74□□□□□ -1.81
HER1Q12276 MEI5YPL121C 669 nt3.74□□□□□ -1.81
HER1Q12276 PHO5YBR093C 1404 nt3.74□□□□□ -1.81
HER1Q12276 YOR022CYOR022C 2148 nt3.74□□□□□ -1.81
HER1Q12276 ECM16YMR128W 3804 nt3.74□□□□□ -1.81
HER1Q12276 GCN5YGR252W 1320 nt3.73□□□□□ -1.81
HER1Q12276 PRM15YMR278W 1869 nt3.73□□□□□ -1.81
HER1Q12276 DSE1YER124C 1722 nt3.73□□□□□ -1.81
HER1Q12276 AIM7YDR063W 450 nt3.73□□□□□ -1.81
HER1Q12276 HMO1YDR174W 741 nt3.73□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 79 ms