Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 YJR128WYJR128W 360 nt3.64□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 MRPL20YKR085C 588 nt3.64□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 SEC14YMR079W 915 nt3.64□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 GRX5YPL059W 453 nt3.64□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 MRPL51YPR100W 423 nt3.64□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 SPT14YPL175W 1359 nt3.63□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 FRE4YNR060W 2160 nt3.63□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 TAO3YIL129C 7131 nt3.63□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 RCR2YDR003W 633 nt3.63□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 YGL117WYGL117W 798 nt3.63□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 YGL230CYGL230C 444 nt3.63□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 VMA7YGR020C 357 nt3.63□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 ERG20YJL167W 1059 nt3.63□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 MTR2YKL186C 555 nt3.63□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 AHP1YLR109W 531 nt3.63□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 HUT1YPL244C 1020 nt3.63□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 YPR027CYPR027C 834 nt3.63□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 YKL050CYKL050C 2769 nt3.63□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 YNR063WYNR063W 1824 nt3.63□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 CDC40YDR364C 1368 nt3.63□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 YIG1YPL201C 1386 nt3.63□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 SLI1YGR212W 1407 nt3.62□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 YFL012WYFL012W 447 nt3.62□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 CWC23YGL128C 852 nt3.62□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 LIP2YLR239C 987 nt3.62□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 IMP4YNL075W 873 nt3.62□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 YNL303WYNL303W 348 nt3.62□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 VAM10YOR068C 345 nt3.62□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 NHP10YDL002C 612 nt3.61□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 SRB7YDR308C 423 nt3.61□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 CDC26YFR036W 375 nt3.61□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 RPL24BYGR148C 468 nt3.61□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 DAL2YIR029W 1032 nt3.61□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 GCD14YJL125C 1152 nt3.61□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 MET14YKL001C 609 nt3.61□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 SFH1YLR321C 1281 nt3.61□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 YOL106WYOL106W 354 nt3.61□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 snR189snR189 189 nt3.61□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 MRPL27YBR282W 441 nt3.61□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 TRM12YML005W 1389 nt3.61□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 YJR061WYJR061W 2808 nt3.61□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 GSC2YGR032W 5688 nt3.61□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 PRP3YDR473C 1410 nt3.61□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 ARO1YDR127W 4767 nt3.6□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 RPN9YDR427W 1182 nt3.6□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 LSM4YER112W 564 nt3.6□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 GTT1YIR038C 705 nt3.6□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 RPC37YKR025W 849 nt3.6□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 YBL065WYBL065W 345 nt3.6□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt3.6□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 MRPL17YNL252C 846 nt3.6□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 HUA2YOR284W 732 nt3.6□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 HPA2YPR193C 471 nt3.6□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 AKR1YDR264C 2295 nt3.6□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 UBP5YER144C 2418 nt3.6□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 IMD4YML056C 1575 nt3.59□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 YDL180WYDL180W 1644 nt3.59□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 VID27YNL212W 2349 nt3.59□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 UBP14YBR058C 2346 nt3.59□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt3.59□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt3.59□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt3.59□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt3.59□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt3.59□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt3.59□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt3.59□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 SMD2YLR275W 333 nt3.59□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 SAM37YMR060C 984 nt3.59□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 FMP41YNL168C 780 nt3.59□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 DIM1YPL266W 957 nt3.59□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 ISW2YOR304W 3363 nt3.59□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 ATG13YPR185W 2217 nt3.59□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 YDR131CYDR131C 1671 nt3.59□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 CEX1YOR112W 2286 nt3.58□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 FAR1YJL157C 2493 nt3.58□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt3.58□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 YGL041W-AYGL041W-A 465 nt3.58□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 SDH3YKL141W 597 nt3.58□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 CSM3YMR048W 954 nt3.58□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 TRM112YNR046W 408 nt3.58□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 YBR096WYBR096W 693 nt3.58□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 NAT1YDL040C 2565 nt3.58□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 SET1YHR119W 3243 nt3.58□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 DSN1YIR010W 1731 nt3.58□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 ROM1YGR070W 3468 nt3.57□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 YHR080CYHR080C 4038 nt3.57□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 SPO71YDR104C 3738 nt3.57□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 GCD6YDR211W 2139 nt3.57□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 MTH1YDR277C 1302 nt3.57□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 LST7YGR057C 729 nt3.57□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 MGA1YGR249W 1371 nt3.57□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt3.57□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 RPC25YKL144C 639 nt3.57□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 YAR075WYAR075W 474 nt3.57□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 ERV15YBR210W 429 nt3.57□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 PMR1YGL167C 2853 nt3.57□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 YBR238CYBR238C 2196 nt3.56□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 LCB5YLR260W 2064 nt3.56□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 HFD1YMR110C 1599 nt3.56□□□□□ -1.84
LSP1Q12230 FUN12YAL035W 3009 nt3.56□□□□□ -1.84
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