Protein–RNA interactions for Protein: Q12127

CCW12, Covalently-linked cell wall protein 12, yeastyeast

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CCW12Q12127 COA4YLR218C 453 nt1.97□□□□□ -2.09
CCW12Q12127 YLR326WYLR326W 723 nt1.97□□□□□ -2.09
CCW12Q12127 CAT5YOR125C 702 nt1.97□□□□□ -2.09
CCW12Q12127 VAC14YLR386W 2643 nt1.97□□□□□ -2.09
CCW12Q12127 IRA2YOL081W 9240 nt1.97□□□□□ -2.09
CCW12Q12127 CUE3YGL110C 1875 nt1.97□□□□□ -2.09
CCW12Q12127 CBP2YHL038C 1893 nt1.97□□□□□ -2.09
CCW12Q12127 YGR237CYGR237C 2358 nt1.96□□□□□ -2.09
CCW12Q12127 NFI1YOR156C 2181 nt1.96□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 MRD1YPR112C 2664 nt1.96□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 SRO9YCL037C 1305 nt1.96□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt1.96□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 YIL086CYIL086C 309 nt1.96□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 RNR2YJL026W 1200 nt1.96□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 SPC3YLR066W 555 nt1.96□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 NDJ1YOL104C 1059 nt1.96□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 NDC80YIL144W 2076 nt1.95□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 CUS1YMR240C 1311 nt1.95□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 ARP8YOR141C 2646 nt1.95□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 DSN1YIR010W 1731 nt1.95□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 YLR001CYLR001C 2589 nt1.95□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 AYT1YLL063C 1425 nt1.95□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 HAT2YEL056W 1206 nt1.95□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 SDP1YIL113W 630 nt1.95□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 CPR7YJR032W 1182 nt1.95□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 YKR075CYKR075C 924 nt1.95□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 PCD1YLR151C 1023 nt1.95□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 BUR2YLR226W 1188 nt1.95□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 RPL23AYBL087C 414 nt1.95□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 YOR331CYOR331C 558 nt1.95□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 ATP25YMR098C 1839 nt1.95□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 RAD7YJR052W 1698 nt1.95□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 FLO11YIR019C 4104 nt1.95□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 DUF1YOL087C 3351 nt1.95□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 PDS1YDR113C 1122 nt1.94□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 DOG1YHR044C 741 nt1.94□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 YKL066WYKL066W 444 nt1.94□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 YKL177WYKL177W 339 nt1.94□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 CDA2YLR308W 939 nt1.94□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 YBR089WYBR089W 600 nt1.94□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 SAP1YER047C 2694 nt1.94□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 HER2YMR293C 1395 nt1.94□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 VPS13YLL040C 9435 nt1.94□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 FKS3YMR306W 5358 nt1.94□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 ERV29YGR284C 933 nt1.93□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 YJL028WYJL028W 336 nt1.93□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 AIM25YJR100C 984 nt1.93□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 USB1YLR132C 873 nt1.93□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 YMR147WYMR147W 672 nt1.93□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 MSN1YOL116W 1149 nt1.93□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 TAF14YPL129W 735 nt1.93□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 FES1YBR101C 873 nt1.93□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 KIN82YCR091W 2163 nt1.93□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 YJL132WYJL132W 2253 nt1.93□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 YVC1YOR087W 2028 nt1.93□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 MMS1YPR164W 4224 nt1.93□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 CHS3YBR023C 3498 nt1.92□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 HBT1YDL223C 3141 nt1.92□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 YPR1YDR368W 939 nt1.92□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 RMT2YDR465C 1239 nt1.92□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 MST27YGL051W 705 nt1.92□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 SYS1YJL004C 612 nt1.92□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 SFH5YJL145W 885 nt1.92□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 GPI14YJR013W 1212 nt1.92□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 MST28YAR033W 705 nt1.92□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 SEC65YML105C 822 nt1.92□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 SSN8YNL025C 972 nt1.92□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 RSM19YNR037C 276 nt1.92□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 YNR062CYNR062C 984 nt1.92□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 USV1YPL230W 1176 nt1.92□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 VBA4YDR119W 2307 nt1.92□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 GAT2YMR136W 1683 nt1.92□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 SEC16YPL085W 6588 nt1.91□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 BUD30YDL151C 582 nt1.91□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 RRP1YDR087C 837 nt1.91□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt1.91□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt1.91□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt1.91□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt1.91□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 YHR213WYHR213W 597 nt1.91□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 YAR062WYAR062W 597 nt1.91□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 YLR347W-AYLR347W-A 141 nt1.91□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt1.91□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 YOR050CYOR050C 348 nt1.91□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 YOR055WYOR055W 435 nt1.91□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 TUM1YOR251C 915 nt1.91□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 MPD1YOR288C 957 nt1.91□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 COA2YPL189C-A 207 nt1.91□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 BMT2YBR141C 1014 nt1.91□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 VAS1YGR094W 3315 nt1.91□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 UBP8YMR223W 1416 nt1.91□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 ABD1YBR236C 1311 nt1.91□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 SKT5YBL061C 2091 nt1.9□□□□□ -2.1
CCW12Q12127 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt1.9□□□□□ -2.11
CCW12Q12127 SWD2YKL018W 990 nt1.9□□□□□ -2.11
CCW12Q12127 RLP7YNL002C 969 nt1.9□□□□□ -2.11
CCW12Q12127 AIM39YOL053W 1188 nt1.9□□□□□ -2.11
CCW12Q12127 RPS11BYBR048W 471 nt1.9□□□□□ -2.11
CCW12Q12127 RRD2YPL152W 1077 nt1.9□□□□□ -2.11
CCW12Q12127 SKP2YNL311C 2292 nt1.9□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 42.5 ms