Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 BOS1YLR078C 735 nt3.45□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 YNL320WYNL320W 855 nt3.45□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 RAS1YOR101W 930 nt3.45□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 IRC13YOR235W 315 nt3.45□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 RPA135YPR010C 3612 nt3.45□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 EBS1YDR206W 2655 nt3.45□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 RTT109YLL002W 1311 nt3.44□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 THR4YCR053W 1545 nt3.44□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 YHR202WYHR202W 1809 nt3.44□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 PIN4YBL051C 2007 nt3.44□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 SNU23YDL098C 585 nt3.44□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 STE14YDR410C 720 nt3.44□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 PAU10YDR542W 363 nt3.44□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt3.44□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt3.44□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt3.44□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt3.44□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt3.44□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt3.44□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt3.44□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 ECO1YFR027W 846 nt3.44□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 MRM2YGL136C 963 nt3.44□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 PAU11YGL261C 363 nt3.44□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 PAU13YHL046C 363 nt3.44□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 SWD2YKL018W 990 nt3.44□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 PAU4YLR461W 363 nt3.44□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 TVP18YMR071C 504 nt3.44□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 GOT1YMR292W 417 nt3.44□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 VAM10YOR068C 345 nt3.44□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 SEA4YBL104C 3117 nt3.44□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 FRE4YNR060W 2160 nt3.44□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 URA2YJL130C 6645 nt3.43□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 DET1YDR051C 1005 nt3.43□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt3.43□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 MMF1YIL051C 438 nt3.43□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 HYM1YKL189W 1200 nt3.43□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 YKT6YKL196C 603 nt3.43□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 DGA1YOR245C 1257 nt3.43□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 RPA43YOR340C 981 nt3.43□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 PRM4YPL156C 855 nt3.43□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 GLC3YEL011W 2115 nt3.43□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 FLO9YAL063C 3969 nt3.43□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 SMC3YJL074C 3693 nt3.42□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 MET14YKL001C 609 nt3.42□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt3.42□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 MCT1YOR221C 1083 nt3.42□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 YOR238WYOR238W 912 nt3.42□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 PHO81YGR233C 3537 nt3.42□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 MTL1YGR023W 1656 nt3.42□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 BMS1YPL217C 3552 nt3.42□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 ARG2YJL071W 1725 nt3.41□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 MDN1YLR106C 14733 nt3.41□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 LRS4YDR439W 1044 nt3.41□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 ECM11YDR446W 909 nt3.41□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 CGR1YGL029W 363 nt3.41□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 LIF1YGL090W 1266 nt3.41□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 YVH1YIR026C 1095 nt3.41□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 AIM23YJL131C 1071 nt3.41□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 CSM3YMR048W 954 nt3.41□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 SAM37YMR060C 984 nt3.41□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 OCA2YNL056W 594 nt3.41□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 PEX11YOL147C 711 nt3.41□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 YOL162WYOL162W 648 nt3.41□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt3.41□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt3.41□□□□□ -1.86
VPS54Q12071 CLB3YDL155W 1284 nt3.4□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 VFA1YER128W 612 nt3.4□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 RPL1BYGL135W 654 nt3.4□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 PTI1YGR156W 1278 nt3.4□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 TDA10YGR205W 873 nt3.4□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 PSF2YJL072C 642 nt3.4□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 PCD1YLR151C 1023 nt3.4□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 RNH203YLR154C 333 nt3.4□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 RPL19BYBL027W 570 nt3.4□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 RPL1AYPL220W 654 nt3.4□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 ATP25YMR098C 1839 nt3.4□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 SQS1YNL224C 2304 nt3.39□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 ITT1YML068W 1395 nt3.39□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 REC8YPR007C 2043 nt3.39□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 SEC15YGL233W 2733 nt3.39□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 BI3Q0115 1554 nt3.39□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 ARP9YMR033W 1404 nt3.39□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 RRP42YDL111C 798 nt3.39□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 DTD1YDL219W 453 nt3.39□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 PEX10YDR265W 1014 nt3.39□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 YHR097CYHR097C 1101 nt3.39□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 ERG20YJL167W 1059 nt3.39□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 YMR099CYMR099C 894 nt3.39□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 RPL13BYMR142C 600 nt3.39□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 FMP41YNL168C 780 nt3.39□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 UFE1YOR075W 1041 nt3.39□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 TYE7YOR344C 876 nt3.39□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 NIP7YPL211W 546 nt3.39□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 STU2YLR045C 2667 nt3.38□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 PKH1YDR490C 2301 nt3.38□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 ARG5,6YER069W 2592 nt3.38□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 UBC9YDL064W 474 nt3.38□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 SHR3YDL212W 633 nt3.38□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 USE1YGL098W 738 nt3.38□□□□□ -1.87
VPS54Q12071 YGR114CYGR114C 390 nt3.38□□□□□ -1.87
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