Protein–RNA interactions for Protein: Q08923

CTI6, Histone deacetylase complex subunit CTI6, yeastyeast

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTI6Q08923 KIP3YGL216W 2418 nt3.84□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 YDR131CYDR131C 1671 nt3.84□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 FUN12YAL035W 3009 nt3.84□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 ISM1YPL040C 3009 nt3.83□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 PDS1YDR113C 1122 nt3.83□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 YDR340WYDR340W 303 nt3.83□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 TLG1YDR468C 675 nt3.83□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 PEX14YGL153W 1026 nt3.83□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 TAN1YGL232W 870 nt3.83□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 YGR111WYGR111W 1203 nt3.83□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 CFD1YIL003W 882 nt3.83□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 ANB1YJR047C 474 nt3.83□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 MET14YKL001C 609 nt3.83□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 YLR290CYLR290C 834 nt3.83□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt3.83□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 TPK2YPL203W 1143 nt3.83□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 YPR136CYPR136C 513 nt3.83□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 NEM1YHR004C 1341 nt3.83□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 PHO5YBR093C 1404 nt3.83□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 GPI10YGL142C 1851 nt3.83□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 SLS1YLR139C 1932 nt3.82□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 GPI1YGR216C 1830 nt3.82□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 RDS2YPL133C 1341 nt3.82□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 ATP5YDR298C 639 nt3.82□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 YIL024CYIL024C 570 nt3.82□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 YMR087WYMR087W 855 nt3.82□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 MCD4YKL165C 2760 nt3.82□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 SMC3YJL074C 3693 nt3.82□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 IMD4YML056C 1575 nt3.81□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 EMC1YCL045C 2283 nt3.81□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 NTO1YPR031W 2247 nt3.81□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 TDA10YGR205W 873 nt3.81□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 YVH1YIR026C 1095 nt3.81□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 YAL004WYAL004W 648 nt3.81□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 POL32YJR043C 1053 nt3.81□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 YAL034C-BYAL034C-B 354 nt3.81□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 CMC1YKL137W 336 nt3.81□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 YAL064WYAL064W 285 nt3.81□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 YLR169WYLR169W 354 nt3.81□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 GPN3YLR243W 819 nt3.81□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 RIM9YMR063W 720 nt3.81□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 YMR099CYMR099C 894 nt3.81□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 TYE7YOR344C 876 nt3.81□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 DIB1YPR082C 432 nt3.81□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt3.81□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 SIN4YNL236W 2925 nt3.81□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 BI3Q0115 1554 nt3.8□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 ART10YLR392C 1557 nt3.8□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 SMI1YGR229C 1518 nt3.8□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 ARG5,6YER069W 2592 nt3.8□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 PAM1YDR251W 2493 nt3.8□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 IOC2YLR095C 2439 nt3.8□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 VAS1YGR094W 3315 nt3.8□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 PMI40YER003C 1290 nt3.8□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 FMP10YER182W 735 nt3.8□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 BCD1YHR040W 1101 nt3.8□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 YIR014WYIR014W 729 nt3.8□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 TEM1YML064C 738 nt3.8□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 FMP41YNL168C 780 nt3.8□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 YNL226WYNL226W 411 nt3.8□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 YTA7YGR270W 4140 nt3.8□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 SEG1YMR086W 2883 nt3.79□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 UBC9YDL064W 474 nt3.79□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 YDL157CYDL157C 357 nt3.79□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 GPP2YER062C 753 nt3.79□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 GEP7YGL057C 864 nt3.79□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 EPT1YHR123W 1176 nt3.79□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 YJR037WYJR037W 384 nt3.79□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 RDN58-1RDN58-1 158 nt3.79□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 RDN58-2RDN58-2 158 nt3.79□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 DIA1YMR316W 1011 nt3.79□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 HUB1YNR032C-A 222 nt3.79□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 YOR331CYOR331C 558 nt3.79□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 PRM4YPL156C 855 nt3.79□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 ARO4YBR249C 1113 nt3.79□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 YDL199CYDL199C 2064 nt3.79□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 RPS29BYDL061C 171 nt3.78□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 HMF1YER057C 390 nt3.78□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 YGL117WYGL117W 798 nt3.78□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 POG1YIL122W 1056 nt3.78□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 RPS21AYKR057W 264 nt3.78□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 YNL319WYNL319W 441 nt3.78□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 TFB2YPL122C 1542 nt3.78□□□□□ -1.8
CTI6Q08923 YEL025CYEL025C 3567 nt3.77□□□□□ -1.81
CTI6Q08923 YME2YMR302C 2553 nt3.77□□□□□ -1.81
CTI6Q08923 CAF130YGR134W 3369 nt3.77□□□□□ -1.81
CTI6Q08923 MPC3YGR243W 441 nt3.77□□□□□ -1.81
CTI6Q08923 SMD3YLR147C 306 nt3.77□□□□□ -1.81
CTI6Q08923 CSM3YMR048W 954 nt3.77□□□□□ -1.81
CTI6Q08923 TRI1YMR233W 681 nt3.77□□□□□ -1.81
CTI6Q08923 GIS2YNL255C 462 nt3.77□□□□□ -1.81
CTI6Q08923 YOR097CYOR097C 528 nt3.77□□□□□ -1.81
CTI6Q08923 DSE1YER124C 1722 nt3.77□□□□□ -1.81
CTI6Q08923 BCH1YMR237W 2175 nt3.77□□□□□ -1.81
CTI6Q08923 YRM1YOR172W 2361 nt3.77□□□□□ -1.81
CTI6Q08923 MIT1YEL007W 2001 nt3.77□□□□□ -1.81
CTI6Q08923 STE24YJR117W 1362 nt3.76□□□□□ -1.81
CTI6Q08923 SEC6YIL068C 2418 nt3.76□□□□□ -1.81
CTI6Q08923 SLM2YNL047C 1971 nt3.76□□□□□ -1.81
CTI6Q08923 THR4YCR053W 1545 nt3.76□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.2 ms