Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDE4CQ08493 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDE4CQ08493 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms