Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE4BQ07343 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms