Protein–RNA interactions for Protein: Q07020

RPL18, 60S ribosomal protein L18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL18Q07020 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPL18Q07020 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPL18Q07020 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPL18Q07020 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RPL18Q07020 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RPL18Q07020 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPL18Q07020 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPL18Q07020 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPL18Q07020 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPL18Q07020 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPL18Q07020 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPL18Q07020 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL18Q07020 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL18Q07020 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL18Q07020 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL18Q07020 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL18Q07020 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL18Q07020 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL18Q07020 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL18Q07020 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL18Q07020 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL18Q07020 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL18Q07020 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL18Q07020 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL18Q07020 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL18Q07020 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL18Q07020 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL18Q07020 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL18Q07020 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL18Q07020 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL18Q07020 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL18Q07020 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL18Q07020 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL18Q07020 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL18Q07020 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms