Protein–RNA interactions for Protein: Q06623

HDA3, HDA1 complex subunit 3, yeastyeast

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3Q06623 SEC27YGL137W 2670 nt5.39□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 MRH1YDR033W 963 nt5.39□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 RPC11YDR045C 333 nt5.39□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 BSC2YDR275W 708 nt5.39□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 CWC21YDR482C 408 nt5.39□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 MRM2YGL136C 963 nt5.39□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 PDR17YNL264C 1053 nt5.39□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 YOR203WYOR203W 354 nt5.39□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 SUE1YPR151C 621 nt5.39□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 DER1YBR201W 636 nt5.39□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 FUS2YMR232W 2034 nt5.39□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 UBA1YKL210W 3075 nt5.38□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 UTR4YEL038W 684 nt5.38□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt5.38□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt5.38□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.38□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.38□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.38□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.38□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.38□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt5.38□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt5.38□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt5.38□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 FMC1YIL098C 468 nt5.38□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 YLR296WYLR296W 327 nt5.38□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 PDP3YLR455W 915 nt5.38□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 RIO2YNL207W 1278 nt5.38□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 YCL022CYCL022C 516 nt5.38□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 UGA1YGR019W 1416 nt5.38□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 FMN1YDR236C 657 nt5.37□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 SPG3YDR504C 384 nt5.37□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 MRP17YKL003C 396 nt5.37□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 PIR1YKL164C 1026 nt5.37□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 TMC1YOR052C 453 nt5.37□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 UBC4YBR082C 447 nt5.37□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 YPR195CYPR195C 330 nt5.37□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 ARR2YPR200C 393 nt5.37□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 CDC55YGL190C 1581 nt5.37□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 PGS1YCL004W 1566 nt5.37□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 OXP1YKL215C 3861 nt5.37□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 DED81YHR019C 1665 nt5.37□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 PDC1YLR044C 1692 nt5.37□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 SUP35YDR172W 2058 nt5.36□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 SUM1YDR310C 3189 nt5.36□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 YDL034WYDL034W 345 nt5.36□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 COX26YDR119W-A 201 nt5.36□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 ARC1YGL105W 1131 nt5.36□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 SSP120YLR250W 705 nt5.36□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 YPR174CYPR174C 666 nt5.36□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 UBP6YFR010W 1500 nt5.36□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 SSZ1YHR064C 1617 nt5.36□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 SNT2YGL131C 4212 nt5.36□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 FRS1YLR060W 1788 nt5.35□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 ZUO1YGR285C 1302 nt5.35□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 GOS1YHL031C 672 nt5.35□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 YHL037CYHL037C 402 nt5.35□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 HSX1tR(CCU)J 72 nt5.35□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 PIN3YPR154W 648 nt5.35□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 FYV5YCL058C 459 nt5.35□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 RIM4YHL024W 2142 nt5.35□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 VPS1YKR001C 2115 nt5.35□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 ERG5YMR015C 1617 nt5.34□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 SEN54YPL083C 1404 nt5.34□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 SUR2YDR297W 1050 nt5.34□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 SLD5YDR489W 885 nt5.34□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 SEC53YFL045C 765 nt5.34□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 ERV1YGR029W 570 nt5.34□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 VMA10YHR039C-A 345 nt5.34□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 NNF1YJR112W 606 nt5.34□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 YLR125WYLR125W 411 nt5.34□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 CSR1YLR380W 1227 nt5.34□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt5.34□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 YOR379CYOR379C 339 nt5.34□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt5.34□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 ALE1YOR175C 1860 nt5.34□□□□□ -1.55
HDA3Q06623 CTM1YHR109W 1758 nt5.34□□□□□ -1.56
HDA3Q06623 MEF2YJL102W 2460 nt5.34□□□□□ -1.56
HDA3Q06623 YLR152CYLR152C 1731 nt5.34□□□□□ -1.56
HDA3Q06623 YHR045WYHR045W 1683 nt5.34□□□□□ -1.56
HDA3Q06623 GEP3YOR205C 1671 nt5.34□□□□□ -1.56
HDA3Q06623 TPO5YKL174C 1857 nt5.33□□□□□ -1.56
HDA3Q06623 snR65snR65 100 nt5.33□□□□□ -1.56
HDA3Q06623 YDL152WYDL152W 366 nt5.33□□□□□ -1.56
HDA3Q06623 API2YDR525W 330 nt5.33□□□□□ -1.56
HDA3Q06623 NTF2YER009W 378 nt5.33□□□□□ -1.56
HDA3Q06623 YGL039WYGL039W 1047 nt5.33□□□□□ -1.56
HDA3Q06623 VPS63YLR261C 327 nt5.33□□□□□ -1.56
HDA3Q06623 YOL134CYOL134C 390 nt5.33□□□□□ -1.56
HDA3Q06623 DCS2YOR173W 1062 nt5.33□□□□□ -1.56
HDA3Q06623 RGT1YKL038W 3513 nt5.33□□□□□ -1.56
HDA3Q06623 FOL1YNL256W 2475 nt5.33□□□□□ -1.56
HDA3Q06623 TFB2YPL122C 1542 nt5.33□□□□□ -1.56
HDA3Q06623 URC2YDR520C 2319 nt5.32□□□□□ -1.56
HDA3Q06623 MAL11YGR289C 1851 nt5.32□□□□□ -1.56
HDA3Q06623 DSL1YNL258C 2265 nt5.32□□□□□ -1.56
HDA3Q06623 STE24YJR117W 1362 nt5.32□□□□□ -1.56
HDA3Q06623 GCS1YDL226C 1059 nt5.32□□□□□ -1.56
HDA3Q06623 YPT32YGL210W 669 nt5.32□□□□□ -1.56
HDA3Q06623 YGR022CYGR022C 330 nt5.32□□□□□ -1.56
HDA3Q06623 LSB1YGR136W 726 nt5.32□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.5 ms