Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ID3Q02535 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ID3Q02535 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ID3Q02535 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ID3Q02535 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ID3Q02535 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ID3Q02535 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ID3Q02535 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ID3Q02535 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ID3Q02535 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ID3Q02535 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ID3Q02535 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ID3Q02535 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ID3Q02535 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ID3Q02535 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ID3Q02535 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ID3Q02535 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ID3Q02535 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ID3Q02535 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ID3Q02535 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ID3Q02535 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ID3Q02535 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ID3Q02535 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ID3Q02535 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ID3Q02535 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ID3Q02535 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ID3Q02535 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ID3Q02535 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ID3Q02535 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ID3Q02535 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ID3Q02535 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ID3Q02535 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ID3Q02535 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ID3Q02535 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ID3Q02535 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ID3Q02535 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ID3Q02535 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ID3Q02535 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ID3Q02535 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ID3Q02535 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ID3Q02535 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ID3Q02535 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ID3Q02535 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ID3Q02535 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ID3Q02535 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ID3Q02535 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ID3Q02535 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ID3Q02535 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ID3Q02535 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ID3Q02535 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ID3Q02535 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ID3Q02535 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
ID3Q02535 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
ID3Q02535 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ID3Q02535 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ID3Q02535 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ID3Q02535 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ID3Q02535 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ID3Q02535 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ID3Q02535 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ID3Q02535 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ID3Q02535 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ID3Q02535 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ID3Q02535 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ID3Q02535 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ID3Q02535 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ID3Q02535 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ID3Q02535 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ID3Q02535 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ID3Q02535 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ID3Q02535 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ID3Q02535 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ID3Q02535 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ID3Q02535 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ID3Q02535 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ID3Q02535 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ID3Q02535 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ID3Q02535 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ID3Q02535 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ID3Q02535 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ID3Q02535 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ID3Q02535 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ID3Q02535 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ID3Q02535 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ID3Q02535 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ID3Q02535 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ID3Q02535 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ID3Q02535 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ID3Q02535 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ID3Q02535 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ID3Q02535 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ID3Q02535 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ID3Q02535 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ID3Q02535 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ID3Q02535 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ID3Q02535 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ID3Q02535 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ID3Q02535 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ID3Q02535 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ID3Q02535 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms