Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms