Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC42EP1Q00587 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC42EP1Q00587 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms