Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK17Q00537 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms