Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL8P80075 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL8P80075 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL8P80075 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL8P80075 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL8P80075 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL8P80075 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL8P80075 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL8P80075 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL8P80075 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL8P80075 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL8P80075 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL8P80075 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL8P80075 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL8P80075 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL8P80075 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL8P80075 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL8P80075 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL8P80075 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL8P80075 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL8P80075 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL8P80075 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL8P80075 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL8P80075 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL8P80075 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL8P80075 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL8P80075 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL8P80075 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL8P80075 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL8P80075 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL8P80075 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL8P80075 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL8P80075 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL8P80075 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL8P80075 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL8P80075 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL8P80075 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL8P80075 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL8P80075 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL8P80075 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL8P80075 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL8P80075 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL8P80075 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL8P80075 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL8P80075 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL8P80075 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL8P80075 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL8P80075 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL8P80075 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL8P80075 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL8P80075 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL8P80075 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL8P80075 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL8P80075 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL8P80075 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL8P80075 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL8P80075 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL8P80075 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL8P80075 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL8P80075 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL8P80075 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL8P80075 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL8P80075 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL8P80075 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL8P80075 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL8P80075 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL8P80075 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL8P80075 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL8P80075 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL8P80075 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL8P80075 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL8P80075 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL8P80075 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL8P80075 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL8P80075 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL8P80075 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL8P80075 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL8P80075 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL8P80075 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL8P80075 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL8P80075 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCL8P80075 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCL8P80075 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CCL8P80075 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCL8P80075 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCL8P80075 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCL8P80075 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCL8P80075 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCL8P80075 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL8P80075 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL8P80075 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL8P80075 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL8P80075 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL8P80075 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL8P80075 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL8P80075 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL8P80075 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL8P80075 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL8P80075 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL8P80075 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms