Protein–RNA interactions for Protein: P70452

Stx4, Syntaxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx4P70452 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx4P70452 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx4P70452 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx4P70452 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx4P70452 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx4P70452 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx4P70452 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx4P70452 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx4P70452 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx4P70452 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx4P70452 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx4P70452 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx4P70452 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx4P70452 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx4P70452 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx4P70452 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx4P70452 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx4P70452 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx4P70452 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx4P70452 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx4P70452 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx4P70452 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx4P70452 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx4P70452 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx4P70452 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx4P70452 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx4P70452 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx4P70452 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx4P70452 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx4P70452 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx4P70452 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx4P70452 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx4P70452 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx4P70452 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx4P70452 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx4P70452 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx4P70452 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx4P70452 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx4P70452 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx4P70452 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx4P70452 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx4P70452 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx4P70452 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx4P70452 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx4P70452 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx4P70452 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx4P70452 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx4P70452 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx4P70452 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx4P70452 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx4P70452 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx4P70452 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx4P70452 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx4P70452 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx4P70452 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx4P70452 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx4P70452 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx4P70452 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx4P70452 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx4P70452 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx4P70452 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx4P70452 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx4P70452 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx4P70452 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx4P70452 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx4P70452 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx4P70452 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx4P70452 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx4P70452 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx4P70452 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx4P70452 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx4P70452 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx4P70452 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx4P70452 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx4P70452 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx4P70452 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx4P70452 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx4P70452 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx4P70452 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx4P70452 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx4P70452 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx4P70452 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx4P70452 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx4P70452 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx4P70452 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx4P70452 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx4P70452 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx4P70452 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx4P70452 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx4P70452 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx4P70452 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx4P70452 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx4P70452 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx4P70452 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx4P70452 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx4P70452 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx4P70452 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx4P70452 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx4P70452 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx4P70452 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms