Protein–RNA interactions for Protein: P62191

PSMC1, 26S proteasome regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC1P62191 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMC1P62191 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMC1P62191 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMC1P62191 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMC1P62191 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMC1P62191 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMC1P62191 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMC1P62191 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMC1P62191 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMC1P62191 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMC1P62191 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMC1P62191 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMC1P62191 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMC1P62191 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMC1P62191 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMC1P62191 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMC1P62191 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMC1P62191 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMC1P62191 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMC1P62191 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMC1P62191 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMC1P62191 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMC1P62191 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMC1P62191 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMC1P62191 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMC1P62191 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMC1P62191 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMC1P62191 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMC1P62191 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMC1P62191 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMC1P62191 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMC1P62191 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMC1P62191 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMC1P62191 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMC1P62191 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMC1P62191 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMC1P62191 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMC1P62191 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms