Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
ERVK11-1P61568 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVK11-1P61568 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms