Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ERVS71-1P61550 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVS71-1P61550 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms