Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP107P57740 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP107P57740 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP107P57740 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP107P57740 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP107P57740 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP107P57740 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP107P57740 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP107P57740 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP107P57740 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP107P57740 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP107P57740 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP107P57740 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP107P57740 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP107P57740 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP107P57740 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP107P57740 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP107P57740 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP107P57740 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP107P57740 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP107P57740 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP107P57740 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP107P57740 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP107P57740 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP107P57740 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP107P57740 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP107P57740 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP107P57740 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP107P57740 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP107P57740 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP107P57740 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP107P57740 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP107P57740 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP107P57740 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP107P57740 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP107P57740 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP107P57740 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP107P57740 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP107P57740 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP107P57740 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP107P57740 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP107P57740 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP107P57740 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP107P57740 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP107P57740 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP107P57740 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP107P57740 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP107P57740 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP107P57740 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP107P57740 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP107P57740 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP107P57740 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP107P57740 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP107P57740 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP107P57740 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP107P57740 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP107P57740 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP107P57740 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP107P57740 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP107P57740 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP107P57740 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP107P57740 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP107P57740 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP107P57740 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP107P57740 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP107P57740 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP107P57740 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP107P57740 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP107P57740 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP107P57740 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP107P57740 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP107P57740 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP107P57740 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP107P57740 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP107P57740 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP107P57740 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP107P57740 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP107P57740 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP107P57740 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP107P57740 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP107P57740 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP107P57740 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP107P57740 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP107P57740 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP107P57740 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP107P57740 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP107P57740 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP107P57740 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP107P57740 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP107P57740 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP107P57740 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP107P57740 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP107P57740 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP107P57740 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP107P57740 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP107P57740 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP107P57740 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP107P57740 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP107P57740 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUP107P57740 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms