Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
AFDNP55196 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
AFDNP55196 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
AFDNP55196 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
AFDNP55196 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
AFDNP55196 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
AFDNP55196 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AFDNP55196 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AFDNP55196 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
AFDNP55196 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AFDNP55196 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AFDNP55196 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AFDNP55196 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
AFDNP55196 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
AFDNP55196 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
AFDNP55196 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
AFDNP55196 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
AFDNP55196 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AFDNP55196 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
AFDNP55196 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AFDNP55196 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
AFDNP55196 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AFDNP55196 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AFDNP55196 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AFDNP55196 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AFDNP55196 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
AFDNP55196 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AFDNP55196 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
AFDNP55196 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
AFDNP55196 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AFDNP55196 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AFDNP55196 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AFDNP55196 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AFDNP55196 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
AFDNP55196 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AFDNP55196 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AFDNP55196 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AFDNP55196 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
AFDNP55196 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
AFDNP55196 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
AFDNP55196 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
AFDNP55196 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
AFDNP55196 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
AFDNP55196 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
AFDNP55196 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
AFDNP55196 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AFDNP55196 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
AFDNP55196 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AFDNP55196 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
AFDNP55196 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
AFDNP55196 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27■■□□□ 1.91
AFDNP55196 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
AFDNP55196 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AFDNP55196 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
AFDNP55196 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AFDNP55196 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
AFDNP55196 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
AFDNP55196 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AFDNP55196 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
AFDNP55196 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AFDNP55196 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
AFDNP55196 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
AFDNP55196 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AFDNP55196 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
AFDNP55196 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
AFDNP55196 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
AFDNP55196 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
AFDNP55196 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
AFDNP55196 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
AFDNP55196 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
AFDNP55196 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AFDNP55196 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AFDNP55196 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AFDNP55196 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
AFDNP55196 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
AFDNP55196 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
AFDNP55196 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
AFDNP55196 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
AFDNP55196 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
AFDNP55196 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
AFDNP55196 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
AFDNP55196 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
AFDNP55196 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
AFDNP55196 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
AFDNP55196 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
AFDNP55196 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
AFDNP55196 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
AFDNP55196 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
AFDNP55196 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
AFDNP55196 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
AFDNP55196 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
AFDNP55196 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
AFDNP55196 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
AFDNP55196 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
AFDNP55196 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
AFDNP55196 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
AFDNP55196 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
AFDNP55196 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
AFDNP55196 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
AFDNP55196 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms