Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PLTPP55058 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PLTPP55058 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PLTPP55058 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PLTPP55058 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLTPP55058 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLTPP55058 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLTPP55058 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLTPP55058 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLTPP55058 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PLTPP55058 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PLTPP55058 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PLTPP55058 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PLTPP55058 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PLTPP55058 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PLTPP55058 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PLTPP55058 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PLTPP55058 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PLTPP55058 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PLTPP55058 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PLTPP55058 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PLTPP55058 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PLTPP55058 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PLTPP55058 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PLTPP55058 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PLTPP55058 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PLTPP55058 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PLTPP55058 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PLTPP55058 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PLTPP55058 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PLTPP55058 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PLTPP55058 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PLTPP55058 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PLTPP55058 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PLTPP55058 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PLTPP55058 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PLTPP55058 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLTPP55058 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLTPP55058 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLTPP55058 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLTPP55058 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLTPP55058 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLTPP55058 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLTPP55058 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLTPP55058 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLTPP55058 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLTPP55058 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLTPP55058 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLTPP55058 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLTPP55058 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLTPP55058 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLTPP55058 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLTPP55058 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLTPP55058 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PLTPP55058 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PLTPP55058 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLTPP55058 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLTPP55058 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLTPP55058 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLTPP55058 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLTPP55058 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLTPP55058 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLTPP55058 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLTPP55058 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLTPP55058 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLTPP55058 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLTPP55058 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PLTPP55058 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLTPP55058 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLTPP55058 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLTPP55058 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLTPP55058 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLTPP55058 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLTPP55058 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLTPP55058 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLTPP55058 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLTPP55058 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLTPP55058 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLTPP55058 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLTPP55058 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLTPP55058 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLTPP55058 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLTPP55058 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLTPP55058 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLTPP55058 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLTPP55058 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLTPP55058 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLTPP55058 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLTPP55058 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLTPP55058 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLTPP55058 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLTPP55058 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLTPP55058 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLTPP55058 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PLTPP55058 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLTPP55058 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLTPP55058 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLTPP55058 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLTPP55058 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLTPP55058 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms