Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
AIF1P55008 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AIF1P55008 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AIF1P55008 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AIF1P55008 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AIF1P55008 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AIF1P55008 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AIF1P55008 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AIF1P55008 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AIF1P55008 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AIF1P55008 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AIF1P55008 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AIF1P55008 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AIF1P55008 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AIF1P55008 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AIF1P55008 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AIF1P55008 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AIF1P55008 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AIF1P55008 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AIF1P55008 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
AIF1P55008 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AIF1P55008 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AIF1P55008 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AIF1P55008 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AIF1P55008 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AIF1P55008 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
AIF1P55008 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AIF1P55008 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AIF1P55008 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AIF1P55008 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AIF1P55008 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AIF1P55008 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AIF1P55008 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AIF1P55008 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
AIF1P55008 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AIF1P55008 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AIF1P55008 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AIF1P55008 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AIF1P55008 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AIF1P55008 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
AIF1P55008 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AIF1P55008 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AIF1P55008 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AIF1P55008 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AIF1P55008 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AIF1P55008 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AIF1P55008 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AIF1P55008 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AIF1P55008 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AIF1P55008 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AIF1P55008 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AIF1P55008 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AIF1P55008 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AIF1P55008 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AIF1P55008 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AIF1P55008 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AIF1P55008 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AIF1P55008 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AIF1P55008 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AIF1P55008 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AIF1P55008 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AIF1P55008 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AIF1P55008 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AIF1P55008 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AIF1P55008 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AIF1P55008 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AIF1P55008 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AIF1P55008 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AIF1P55008 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AIF1P55008 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AIF1P55008 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AIF1P55008 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AIF1P55008 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AIF1P55008 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AIF1P55008 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AIF1P55008 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AIF1P55008 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AIF1P55008 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AIF1P55008 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AIF1P55008 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AIF1P55008 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AIF1P55008 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AIF1P55008 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AIF1P55008 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AIF1P55008 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AIF1P55008 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AIF1P55008 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AIF1P55008 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AIF1P55008 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AIF1P55008 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AIF1P55008 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AIF1P55008 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AIF1P55008 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AIF1P55008 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AIF1P55008 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AIF1P55008 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AIF1P55008 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AIF1P55008 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AIF1P55008 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AIF1P55008 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms