Protein–RNA interactions for Protein: P54829

PTPN5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN5P54829 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN5P54829 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN5P54829 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms