Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHB3P54753 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHB3P54753 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms